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復旦大學生命科學學院、遺傳工程國家重點實驗室甘建華課題組與李繼喜課題組合作研究揭示了非洲豬瘟病毒(ASFV)DNA連接酶(AsfvDNAL)的分子機制。該項成果近日在線發(fā)表于《自然—通訊》。
ASFV是一種獨特的雙鏈DNA病毒,能導致受感染豬死亡,受到了科研人員的廣泛關(guān)注,盡管已研究了100多年,目前仍沒有任何有效的疫苗被報道。ASFV對全球多個國家和地區(qū)的豬飼養(yǎng)業(yè)都是一種巨大的威脅,并于2018年在中國首度暴發(fā),導致了嚴重的經(jīng)濟損失。
ASFV中有一套完整的DNA修復通路。與通常的DNA修復通路不同,ASFV的DNA修復通路中的聚合酶和連接酶的保真性都非常低,在ASFV基因組的修復和突變過程中均發(fā)揮了關(guān)鍵作用。
據(jù)悉,該團隊此前研究發(fā)現(xiàn),AsfvPolX擁有一個獨特的磷酸根識別位點,對其底物結(jié)合和催化活性十分關(guān)鍵。“AsfvDNAL與同源蛋白的序列相似性很低,但其容忍堿基錯配的分子機制還不明確。”該論文第一作者陳屹勍告訴《中國科學報》,研究人員利用X射線晶體學方法,成功解析了AsfvDNAL與不同類型DNA復合物的高分辨率結(jié)構(gòu)。
晶體結(jié)構(gòu)顯示,AsfvDNAL具有一個獨特的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域?qū)Φ孜锝Y(jié)合十分重要。雖然AsfvDNAL與常見的DNA連接酶在催化機制方面保守,但AsfvDNAL在底物催化位點附近具有一些明顯不同的氨基酸組成。
“蛋白突變、體外DNA結(jié)合以及活性研究顯示,催化位點附近的氨基酸對催化形式AsfvDNAL-DNA復合物的形成及活性至關(guān)重要。”甘建華表示,這項研究成果為針對非洲豬瘟病毒DNA修復通路蛋白的藥物設(shè)計提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
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